Hội đồng Quản lý Quỹ có 07 thành viên, được Chủ tịch Viện Hàn lâm thành lập và bổ nhiệm trên cơ sở đề xuất của Ban Tổ chức - Cán bộ và Kiểm tra, gồm: Chủ tịch, 02 Phó Chủ tịch và các thành viên là các nhà quản lý, nhà khoa học, làm việc theo chế độ chuyên trách hoặc kiêm nhiệm, cụ thể:
- Ông Lê Trường Giang- Phó Chủ tịch Viện Hàn lâm Khoa học và Công nghệ Việt Nam, Chủ tịch Hội đồng Quỹ
- Ông Nguyễn Thanh Hải, Phó Giám đốc Ban Quản lý Dự án xây dựng Trường Đại học Khoa học và Công nghệ Hà Nội, Phó Chủ tịch Hội đồng Quỹ
- Ông Bùi Trọng Tuyên, Trưởng ban Kế hoạch – Tài chính, Thành viên Hội đồng Quỹ
- Ông Phan Tiến Dũng, Trưởng ban Ứng dụng và Triển khai công nghệ, Thành viên Hội đồng Quỹ
- Bà Lê Quỳnh Liên, Trưởng ban Hợp tác quốc tế, Thành viên Hội đồng Quỹ
- Ông Trần Đại Lâm, Viện trưởng Viện Khoa học vật liệu, Thành viên Hội đồng Quỹ
- Ông Trần Ngọc Quyển, Viện trưởng Viện Công nghệ tiên tiến, Thành viên Hội đồng Quỹ.
- Ông Phạm Minh Tuấn, Giám đốc Quỹ, thành viên Hội đồng Quỹ
- Bà Phan Thu Hà, Phó trưởng ban KHTC, Trưởng ban kiểm soát Quỹ, thành viên Hội đồng Quỹ
